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湛江中心人民医院关于湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台计算集群II期建设项目推介信息发布湛中心医信息科【2023】34号

作者: 信息科 来源: 信息科 编辑: 郑帅 发布时间: 2023-11-09 点击数: 1456


一、项目名称:

湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台计算集群II期建设。

二、背景:

生物信息学分析平台已于2021年11月完成一体化标准机房和计算集群I期建设并正式投入使用,目前配备2个登录/管理节点、8个计算节点和总容量为656 TB的存储节点。基于生物信息学分析平台当前使用情况和未来需求,需要开展计算集群II期建设对计算节点和存储节点进行扩容建设。

三、建设内容要求:

1、拟采购内容

计算集群II期建设内容包括28个CPU计算单元、3个胖节点、1套裸容量为1312TB的高性能存储以及配套的硬件和软件模块等。(详见附表一、附表二)

附表一:拟购内容清单:

序号

设备名称

数量

单位

备注

1

CPU计算单元

28

技术要求见附表二

2

胖节点

3

技术要求见附表二

3

高性能存储(扩容)

2

技术要求见附表二

4

网络设备(线缆)

1

技术要求见附表二

5

配套软件

1

技术要求见附表二

6

编译器及数学库&并行环境

1

技术要求见附表二

7

集成服务

1

技术要求见附表二

附表二:技术要求

序号

标的名称

数量

单位

描述

备注

1

CPU计算单元

28

刀片机箱,冗余风扇电源;≥2*Intel Xeon Gold 6330 28C 205W 2.0GHz Processor处理器;内存:≥12*32GB TruDDR4 3200MHz (2Rx8 1.2V) RDIMM;硬盘:≥480GB企业级SSD盘;1块Mellanox  ConnectX-6 HDR/200GbE QSFP56 1-port PCIe 4  VPI Adapter IB卡。

 

2

胖节点

3

2颗≥Intel Xeon Platinum 8358P 32C 240W 2.6GHz处理器;内存:≥1.5TB(24*64GB) TruDDR4 3200MHz (2Rx8 1.2TruDDR4 3200MHz (2Rx8 1.2V) RDIMM;硬盘:2块≥480GB企业级SSD盘,1块≥3.2TB Nvme硬盘;1块Mellanox ConnectX-6 HDR/200GbE QSFP56 1-port PCIe 4 VPI Adapter IB卡;配置冗余热插拔电源。

 

3

高性能存储(扩容)

1

现有DSS-G增加两套高密度扩展机柜,含164块8TB硬盘以上裸容量及相关软件许可,

IO读写性能≥15GB/s, IB 接口

 

4

网络设备

1

1台≥40Port EDR 200Gb/s Infiniband智能交换机;
≥32根2m Mellanox HDR IB Passive Copper QSFP56 Cable;
≥32根2m 千兆线缆。

 

5

配套软件

1、集群管理模块:62

2、集群作业调度控制模块:41

1、集群管理模块:要求为商业版集群管理软件,与服务器同一品牌;集群操作:WEB图形界面/并行命令/用户管理等;健康监控:提供集群的健康状态监控;作业调度:提供集群作业调度策略及管理:支持LSF/PBS/SLURM;计费管理:提供对计费账户充值、扣款及汇率修改等管理功能;系统部署:提供对集群系统软件的快速部署和自动配置;包含配套集群操作系统。

2、集群作业调度控制模块:负载管理与作业调度模块,以应用为中心的Web界面;要求为国内外广泛使用的商业版作业调度软件,不接受基于开源软件二次开发的软件产品。

 

6

编译器及数学库&并行环境

1

Intel® Parallel Studio XE Cluster Edition for Linux, commercial edition
Intel C/C++/Fortran,MKL,TBB,IPP、Advisor、Inspector、Vtune、MPI、Trace tool
OpenMPI, MPICH, MVAPICH/MVAPICH2等并行环境

 

7

集成服务

1

网线、光纤、跳线、管材、设备上架等

 

备注:计算集群一期建设内容参考附件一。

四、报名要求:

1、具备《中华人民共和国政府采购法》第二十二条资格条件:(1)具有独立承担民事责任的能力;(2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;(3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;(4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;(5)参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;(6)法律、行政法规规定的其他条件。

2、报名文件包含但不限于:技术方案、设备清单、总价及各项单项报价、售后服务、联系人等。

五、采购信息公告期限:

5个日历日。

六、报价文件递交截止时间要求:

符合条件的供应商请在信息公告结束前(逾期不予受理),把报价文件及相关服务承诺(格式自拟)、资质条件证明等文件以快递或当面送达形式送达我院,地址:湛江中心人民医院11号楼(行政楼)3层信息科。

七、联系方式:

信息科 欧工: 0759-3215271或 13824828864

附件一:计算集群一期建设内容参考:http://dr0759.com/zxy/portal/article.action?articleId=2c9f7a81764a21510176b41da77d4397&columnId=402881096699e32e016699e707f3003c 

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信息科       

2023年11月9日

 

 

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